期刊简介
本杂志由广东省口腔医院、广东省牙病防治指导组主办,是国家科委批准公开发行的学术期刊。本刊有下列专栏:论著及应用研究,预防与社会医学,防治实践,新技术应用,口腔护理,临床报告,专题论述,综述,讲座等。对迅速反映牙病防治新技术、新方法、新材料的稿件最为欢迎,并优先安排审稿和发稿,对本刊长期订户的来稿,亦优先安排审稿和发稿。
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- 杂志名称:口腔疾病防治杂志
- 主管单位:广东省卫生和计划生育委员会
- 主办单位:广东省口腔医院,广东省牙病防治指导中心
- 国际刊号:1006-5245
- 国内刊号:44-1407/R
- 出版周期:月刊
期刊荣誉:中国学术期刊(光盘版)全文收录期刊期刊收录:万方收录(中), 维普收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 国家图书馆馆藏, 上海图书馆馆藏, 知网收录(中)
舌鳞癌组织长链非编码RNA的Ion Torrent高通量检测和分析
欧阳可雄;梁军;邹瑞;李志强;白植宝;朴正国;赵建江
关键词:长链非编码RNA, 舌鳞癌, 高通量测序
摘要:目的 研究舌鳞癌组织及其癌旁组织之间长链非编码RNA( long non-coding RNA,LncRNA)表达谱的差异,探讨LncRNA在基因调控中的作用. 方法 应用Ion Torrent高通量测序技术对1例新鲜舌鳞癌组织及其癌旁组织的LncRNA表达谱进行检测比较. 将测出的LncRNA序列和Ensemble 6. 8数据库中LncRNA的数据进行比对,用Bowtie2的方法挑出LncRNA的读序,然后用Cufflinks方法计算LncRNA每百万读序中来自某基因每千碱基长度的读序数( reads per kilo bases per million reads,RPKM). 截取癌症组织比癌旁组织RPKM值大于10和小于0. 1的LncRNA作为候选目标. 结果 纳入候选目标LncRNA的有52个,其中表达上调的有28个,表达下调的有24个. 结论 舌鳞癌组织和癌旁组织中存在差异表达的LncRNA分子,提示其靶基因有可能成为舌鳞癌基因治疗的潜在靶点.
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